Миру снова нужны по‑настоящему отважные герои, способные встать на защиту людей перед лицом невиданной угрозы. На Земле появляется новая форма жизни, получившая название «Сэйвиджи» — существа, представляющие смертельную опасность не только отдельным людям, но и всему человеческому роду. В ответ на это учёные создают принципиально новое оружие под названием «Сотня», единственное, что способно окончательно уничтожить этих беспощадных монстров. Однако вскоре выясняется, что овладеть «Сотней» под силу лишь избранным. Чтобы найти и подготовить таких бойцов, во всём мире открываются специализированные учебные заведения для юношей и девушек, где они проходят интенсивные тренировки и участвуют в поединках, шлифуя боевые навыки.
Главный герой истории, Хаято Кисараги, давно мечтает стать величайшим мастером «Сотни» и уже имеет опыт защиты себя и других от атак Сэйвиджей. Стремясь развить свои способности, он поступает в особый университет, целиком посвящённый подготовке элитных воинов, владеющих этим оружием. Там он неожиданно встречает знакомую девушку, которую однажды спас, а теперь она становится его соседкой по комнате. Вскоре Хаято предстоит выдержать серьёзное испытание — дуэль с президентом студенческого совета Клэр Харви, самым сильным бойцом университета. Этот поединок становится для него отправной точкой на пути к настоящему боевому мастерству.